- Инструкция № 1 от 15 април 2018 г. за реда за осъществяване на оперативно-издирвателна дейност чрез специфични способи и средства от органите на чл. 16, ал. 2 от ЗПКОНПИ, обн. в ДВ бр. 70/24.08.2018 г. (поверително);
- Инструкция № 4 от 15 май 2019 г. за взаимодействие между КПКОНПИ и Държавна агенция „Национална сигурност“ за изпълнение на дейностите по глава девета от органите по чл. 16, ал. 2 от Закона за противодействие на корупцията и за отнемане на незаконно придобитото имущество, обн. в ДВ бр. 62/06.08.2019 г. (поверително);
- Инструкция № 5 от 05 юни 2019 г. за взаимодействие между КПКОНПИ и Държавна агенция „Технически операции“ за изпълнение на дейностите по глава девета от органите по чл. 16, ал. 2 от ЗПКОНПИ, обн. в ДВ бр. 62/06.08.2019 г. (поверително);
- Инструкция № 3 от 16 септември 2020 г. за взаимодействие между КПКОНПИ и Държавна агенция „Разузнаване“, обн. в ДВ бр. 87/09.10.2020 г. (поверително);
- Инструкция № 4 от 28 октомври 2020 г. за реда и сроковете за осъществяване на взаимодействието между Министерството на вътрешните работи и органите по чл. 16, ал. 2 от ЗПКОНПИ, обн.в ДВ бр. 103/04.12.2020 г. (поверително).